Molecular Operating Environment简称moe，这是为专业的工程人员打造的应用程序的操作和分析化合物的大集合，软件提供了丰富的功能模块，拥有完全集成的计算化学、分子建模和信息软件，和用于生命科学的应用套件，小编提供的这个是最新版本，还增加了全新的功能，有需要的用户快快下载吧。

安装教程

1，右键管理员身份运行moe2015_10_installer_win.exe，安装软件

2，软件安装完成后，解压patcher-win.zip，复制patch.exe到软件安装目录下

默认路径C:\moe2015

右键管理员身份运行patch.exe打补丁

3，打开MOE_2015_patch文件夹：

复制license.dat到C:\moe2015替换原文件

复制chemcompd.exe、moe.exe、moebatch.exe到下面的路径中替换原文件

C:\moe2015\bin

C:\moe2015\bin-i4w9

C:\moe2015\bin-win64

4，安装破解完成

软件特色

分子显示和操作环境分子建模

分子结构显示

无论生物大分子、有机小分子还是水分子、金属离子在MOE里都能以非常精美的图像展示给用户。MOE支持各种形式的分子结构渲染方法同时还支持红蓝、QuadBuffer主动三维立体显示技术让您能够身入其境的观察和操作分子。

相互作用显示

MOE里可以直观地观察分子间相互作用例如氢键、盐键、疏水相互作用、PI-PI相互作用等。您既可以看到大分子内部的氢键网络也可以看到受体-配体间重要的相互作用。

氨基酸\碱基序列显示 序列编辑器可以让您方便地查看蛋白或核酸的序列。在这里可以选中特定的残基进行渲染、修改或其它操作。水分子、配体、离子等同样可以在序列编辑器里显示并操作。

批量分子结构数据显示 数据库浏览器DBV可以批量地导入分子结构及其他相关数据。在这里分子结构以在MOE主窗口里同样的方式显示并可以缩放、旋转。

主要亮点

生物制剂：丙氨酸/二硫化物/抗性/残留扫描，序列设计，斑贴分析仪，性质，旋转探针，抗体建模

生物信息学：结构和家庭数据库，折叠/同源识别，激酶搜索，对齐，叠加，共识

蛋白质建模：同源建模，残留突变，力学，动力学，分析，蛋白质pKa

基于配体的药物设计：配体探针，药物化学转化，BREED：3D配体生成器，支架置换，片段分析，溶剂化，药效团发现，构象分析，原体和互变异构体

基于结构的药物设计：溶剂分析，表面和图谱，对接，蛋白质 – 配体相互作用和指纹，3D质子化状态分配，原子和互变异构体

化学信息学：描述符，相似性和多样性，构象数据库，3D搜索，药效团查询/解析/连接子，2D描述，结构活动分析，RECAP分析，SD管道命令

高吞吐量发现：组合库设计，HTS分析，二进制QSAR

分子模拟和模拟：力场，静电学，力学，动力学，衍射，3D分子构建器，分子表面

方法开发和部署：原型设计，集成，分布式计算

MOE / web：SD过滤器，结构活动报告，同源搜索，小分子属性，数据库浏览器，SOAP服务器

使用教程

1.在MOE窗口open打开一个有小配体的蛋白(PDB或moe文件)

点击Compute→prepare→Protonate3D(使质子化)点击OK。打开SEQ面板

删去水分子和与小配体无关的其他杂配体或离子

在MOE窗口右边点击SiteView

点击System，改变配体颜色

使得小配体显示绿色C骨架

在MOE窗口点击Surface→recepter

在MOE窗口点击Surface→SurfaceandMaps改变口袋表面的透明度

在SurfaceandMaps面板调节如图所示

在MOE窗口会看到如下图所示：

接下来对接一个小配体

点击Compute→dock

在Recepter选项选择Recepter+Solvent

其它选择默认值。

点击Run。

在表单你会看到有不同的构象对接结果，包括RMSD值。

口袋对接结果