Primer Premier 5是为医药行业的用户打造的一款实用引物设计软件，软件可以方便专业的人员进行PCR、测序引物、杂交探针的设计操作，集合了酶切分析窗口、纹基分析窗口、引物设计窗口、序列编辑窗口等，可以方便用户快速得出引物分析的结果，软件还可以针对模板dna的来源以相应的遗传密码规则转换dna 和氨基酸序列，有需要的用户快快下载吧。

安装教程

1、双击“Primer Premier 5.exe”进入到软件操作界面

2、打开软件之后将会弹出以下界面，点击Active Product按钮，看到一个2位数的Machine ID

3、把Machine ID输入Primer Keygen，点击Generate生成激活码

4、把激活码输入Primer Premier，点击ok即可弹跳出成功的指示

5、然后就可以使用软件的全部功能了

软件特色

-给专业人员带来的极大的便利，另外小编为大家带来的这款最新版本功能更加强大，立足点也是按照引物设计的基本原则，只是更加快速和自动化而已

-是款用软件设计引物软件，该软件分为四大块，尤其常用的是引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA 基元(motif)查找

-我们可以直接提交模板序列到特定网页，如著名的primer3，得到设计好的引物，也可以在本地计算机上运行引物设计专业软件

主要功能

1、软件的主要功能分四种，即引物设计、限制性内切酶位点分析、dna 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三种为其主要功能。此外，该软件还有一些特殊功能，其中最重要的是设计简并引物，另外还有序列朗读、dna 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。

2、还可以针对模板dna 的来源以相应的遗传密码规则转换dna 和氨基酸序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则

供用户选择，有纤毛虫大核(ciliate macronuclear)、无脊椎动物线粒体(invertebrate mitochondrion)、支原体(mycoplasma)、植物线粒体(plant mitochondrion)、原生动物线粒体(protozoan mitochondrion)、一般标准

(standard)、脊椎动物线粒体(vertebrate mito-chondrion)和酵母线粒体(yeast mitochondrion)。

使用技巧

一、限制性酶切点分析及基元查找功能

1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析及基元查找功能比较简单，点击该功能按钮后，选择相应的限制性内切酶或基元(如-10 序列，-35 序列等)，按确定即可

2.常见的限制性内切酶和基元一般都可以找到,你还可以编辑或者添加新限制性内切酶或基元

二、引物设计

1.打开DNA序列后点击按钮primer，出现“search criteria”窗口，有多种参数可以调整

2.搜索目的(Seach For)有三种选项，PCR 引物(PCR Primers)、测序引物(Sequencing Primers)和杂交探针(Hybridization Probes)

3.搜索类型(Search Type)可选择分别或同时查找上、下游引物(Sense/Anti-sense Primer，或Both)，或者成对查找(Pairs)，或者分别以适合上、下游引物为主(Compatible with Sense/Anti-sense Primer)。另外还可改变选择区域(Search Ranges)，引物长度(Primer Length)，选择方式(Search Mode)，参数选择(Search Parameters)等等

3.使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。然后按search，随之出现的Search Progress 窗口中显示Search Completed 时，再按OK，这时搜索结果以表格的形式出现，有三种显示方式，上游引物(Sense)，下游引物(Anti-sense)，成对显示(Pairs)。默认显示为成对方式，并按优劣次序(Rating)排列，满分为100，即各指标基本都能达标

三、引物点击

1.点击其中一对引物，如第1#引物，并把上述窗口挪开或退出，显示“Peimer Premier”主窗口，所得结果分三部分，

2.模板及产物位置，中间是所选的上下游引物的一些性质，最下面是四种重要指标的分析，包括发夹结构(Hairpin)，二聚体(Dimer)，错误引发情况(False Priming)，及上下游引物之间二聚体形成情况(Cross Dimer)

3.当所分析的引物有这四种结构的形成可能时，按钮由变成，点击该按钮，在左下角的窗口中就会出现该结构的形成情况

4.一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构，因此最好的情况是最下面的分析栏没有，只有。值得注意的是中间一栏的末尾给出该引物的最佳退火温度

四、引物修饰编辑

1.在需要对引物进行修饰编辑时，如在5’端加入酶切位点，可点击，然后修改引物序列

2.若要回到搜索结果中，则点击按钮。如果要设计简并引物，只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述的八种遗传密码规则，反推至DNA 序列即可3.对简并引物的分析不需像一般引物那样严格

4.总之，“Premier”有优秀的引物自动搜索功能，同时可进行部分指标的分析，而且容易使用，是一个相当不错的软件